Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKAP1Q86WV1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms