Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVN7

SEM1, Putative protein SEM1, isoform 2, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEM1Q6ZVN7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEM1Q6ZVN7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms