Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN7

SLCO4C1, Solute carrier organic anion transporter family member 4C1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO4C1Q6ZQN7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO4C1Q6ZQN7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO4C1Q6ZQN7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO4C1Q6ZQN7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO4C1Q6ZQN7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO4C1Q6ZQN7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO4C1Q6ZQN7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO4C1Q6ZQN7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO4C1Q6ZQN7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO4C1Q6ZQN7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO4C1Q6ZQN7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO4C1Q6ZQN7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO4C1Q6ZQN7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO4C1Q6ZQN7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO4C1Q6ZQN7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO4C1Q6ZQN7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO4C1Q6ZQN7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO4C1Q6ZQN7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO4C1Q6ZQN7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO4C1Q6ZQN7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO4C1Q6ZQN7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO4C1Q6ZQN7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO4C1Q6ZQN7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO4C1Q6ZQN7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO4C1Q6ZQN7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO4C1Q6ZQN7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO4C1Q6ZQN7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO4C1Q6ZQN7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO4C1Q6ZQN7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO4C1Q6ZQN7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO4C1Q6ZQN7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO4C1Q6ZQN7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO4C1Q6ZQN7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO4C1Q6ZQN7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO4C1Q6ZQN7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms