Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms