Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms