Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q5VSD8 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Q5VSD8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q5VSD8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q5VSD8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q5VSD8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Q5VSD8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q5VSD8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q5VSD8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q5VSD8 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q5VSD8 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q5VSD8 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q5VSD8 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q5VSD8 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q5VSD8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q5VSD8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q5VSD8 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q5VSD8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q5VSD8 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q5VSD8 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q5VSD8 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q5VSD8 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q5VSD8 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q5VSD8 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q5VSD8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q5VSD8 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q5VSD8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q5VSD8 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q5VSD8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q5VSD8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q5VSD8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q5VSD8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q5VSD8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q5VSD8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q5VSD8 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q5VSD8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q5VSD8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q5VSD8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q5VSD8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q5VSD8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q5VSD8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q5VSD8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q5VSD8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q5VSD8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q5VSD8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q5VSD8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q5VSD8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q5VSD8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q5VSD8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q5VSD8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q5VSD8 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q5VSD8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q5VSD8 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q5VSD8 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q5VSD8 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q5VSD8 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q5VSD8 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q5VSD8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q5VSD8 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q5VSD8 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q5VSD8 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q5VSD8 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q5VSD8 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms