Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HDGFL1Q5TGJ6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDGFL1Q5TGJ6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDGFL1Q5TGJ6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDGFL1Q5TGJ6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDGFL1Q5TGJ6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDGFL1Q5TGJ6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDGFL1Q5TGJ6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDGFL1Q5TGJ6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDGFL1Q5TGJ6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HDGFL1Q5TGJ6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDGFL1Q5TGJ6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDGFL1Q5TGJ6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HDGFL1Q5TGJ6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDGFL1Q5TGJ6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDGFL1Q5TGJ6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDGFL1Q5TGJ6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDGFL1Q5TGJ6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDGFL1Q5TGJ6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDGFL1Q5TGJ6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDGFL1Q5TGJ6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDGFL1Q5TGJ6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDGFL1Q5TGJ6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDGFL1Q5TGJ6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDGFL1Q5TGJ6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDGFL1Q5TGJ6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDGFL1Q5TGJ6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDGFL1Q5TGJ6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDGFL1Q5TGJ6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDGFL1Q5TGJ6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDGFL1Q5TGJ6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDGFL1Q5TGJ6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDGFL1Q5TGJ6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDGFL1Q5TGJ6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDGFL1Q5TGJ6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HDGFL1Q5TGJ6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDGFL1Q5TGJ6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDGFL1Q5TGJ6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms