Protein–RNA interactions for Protein: Q5PT55

SLC10A5, Sodium/bile acid cotransporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A5Q5PT55 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A5Q5PT55 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms