Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms