Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms