Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms