Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms