Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms