Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms