Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms