Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms