Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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