Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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E2F4Q16254 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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E2F4Q16254 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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E2F4Q16254 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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E2F4Q16254 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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E2F4Q16254 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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