Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCBQ16143 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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