Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SF1Q15637 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SF1Q15637 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SF1Q15637 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SF1Q15637 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SF1Q15637 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SF1Q15637 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SF1Q15637 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SF1Q15637 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SF1Q15637 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SF1Q15637 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SF1Q15637 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SF1Q15637 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SF1Q15637 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SF1Q15637 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SF1Q15637 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SF1Q15637 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SF1Q15637 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SF1Q15637 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SF1Q15637 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SF1Q15637 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SF1Q15637 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SF1Q15637 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SF1Q15637 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SF1Q15637 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SF1Q15637 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SF1Q15637 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SF1Q15637 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SF1Q15637 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SF1Q15637 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SF1Q15637 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SF1Q15637 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SF1Q15637 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SF1Q15637 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SF1Q15637 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SF1Q15637 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SF1Q15637 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SF1Q15637 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SF1Q15637 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SF1Q15637 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SF1Q15637 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SF1Q15637 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SF1Q15637 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SF1Q15637 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SF1Q15637 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SF1Q15637 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SF1Q15637 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SF1Q15637 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SF1Q15637 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SF1Q15637 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SF1Q15637 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SF1Q15637 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SF1Q15637 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SF1Q15637 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SF1Q15637 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
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SF1Q15637 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SF1Q15637 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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SF1Q15637 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SF1Q15637 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SF1Q15637 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SF1Q15637 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SF1Q15637 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SF1Q15637 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SF1Q15637 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SF1Q15637 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SF1Q15637 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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SF1Q15637 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SF1Q15637 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SF1Q15637 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SF1Q15637 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SF1Q15637 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SF1Q15637 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SF1Q15637 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SF1Q15637 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SF1Q15637 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SF1Q15637 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SF1Q15637 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SF1Q15637 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SF1Q15637 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SF1Q15637 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SF1Q15637 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SF1Q15637 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SF1Q15637 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SF1Q15637 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SF1Q15637 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SF1Q15637 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SF1Q15637 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SF1Q15637 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SF1Q15637 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SF1Q15637 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SF1Q15637 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SF1Q15637 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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