Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRADDQ15628 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms