Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTF1Q15361 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
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