Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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