Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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