Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms