Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK13Q14004 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
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