Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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