Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms