Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTGDRQ13258 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTGDRQ13258 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTGDRQ13258 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTGDRQ13258 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTGDRQ13258 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTGDRQ13258 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTGDRQ13258 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTGDRQ13258 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTGDRQ13258 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTGDRQ13258 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PTGDRQ13258 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTGDRQ13258 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms