Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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