Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms