Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
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