Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFX1Q12986 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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