Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms