Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX10Q12887 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COX10Q12887 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX10Q12887 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX10Q12887 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX10Q12887 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX10Q12887 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX10Q12887 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX10Q12887 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX10Q12887 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX10Q12887 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX10Q12887 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COX10Q12887 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX10Q12887 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX10Q12887 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX10Q12887 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COX10Q12887 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX10Q12887 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX10Q12887 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX10Q12887 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX10Q12887 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX10Q12887 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX10Q12887 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX10Q12887 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX10Q12887 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX10Q12887 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX10Q12887 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX10Q12887 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX10Q12887 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX10Q12887 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX10Q12887 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COX10Q12887 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX10Q12887 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COX10Q12887 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COX10Q12887 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COX10Q12887 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COX10Q12887 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COX10Q12887 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COX10Q12887 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COX10Q12887 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COX10Q12887 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COX10Q12887 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COX10Q12887 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COX10Q12887 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COX10Q12887 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COX10Q12887 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COX10Q12887 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COX10Q12887 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COX10Q12887 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COX10Q12887 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COX10Q12887 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COX10Q12887 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COX10Q12887 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COX10Q12887 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COX10Q12887 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COX10Q12887 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COX10Q12887 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COX10Q12887 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COX10Q12887 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COX10Q12887 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COX10Q12887 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms