Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms