Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms