Protein–RNA interactions for Protein: Q10472

GALNT1, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT1Q10472 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GALNT1Q10472 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms