Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms