Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms