Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms