Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms