Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMF1P82094 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMF1P82094 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMF1P82094 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMF1P82094 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMF1P82094 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMF1P82094 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMF1P82094 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMF1P82094 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMF1P82094 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMF1P82094 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMF1P82094 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMF1P82094 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TMF1P82094 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMF1P82094 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMF1P82094 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMF1P82094 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TMF1P82094 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMF1P82094 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMF1P82094 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMF1P82094 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMF1P82094 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMF1P82094 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMF1P82094 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMF1P82094 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMF1P82094 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMF1P82094 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMF1P82094 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMF1P82094 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMF1P82094 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMF1P82094 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMF1P82094 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMF1P82094 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMF1P82094 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMF1P82094 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMF1P82094 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMF1P82094 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMF1P82094 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMF1P82094 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMF1P82094 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMF1P82094 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMF1P82094 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMF1P82094 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMF1P82094 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMF1P82094 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TMF1P82094 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMF1P82094 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TMF1P82094 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMF1P82094 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TMF1P82094 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMF1P82094 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMF1P82094 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMF1P82094 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMF1P82094 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMF1P82094 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMF1P82094 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMF1P82094 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMF1P82094 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMF1P82094 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMF1P82094 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMF1P82094 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMF1P82094 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMF1P82094 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TMF1P82094 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMF1P82094 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMF1P82094 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TMF1P82094 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMF1P82094 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMF1P82094 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TMF1P82094 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMF1P82094 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMF1P82094 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMF1P82094 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMF1P82094 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMF1P82094 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMF1P82094 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMF1P82094 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMF1P82094 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMF1P82094 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMF1P82094 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMF1P82094 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMF1P82094 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TMF1P82094 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMF1P82094 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMF1P82094 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMF1P82094 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMF1P82094 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMF1P82094 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMF1P82094 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMF1P82094 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMF1P82094 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMF1P82094 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMF1P82094 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMF1P82094 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMF1P82094 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMF1P82094 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMF1P82094 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMF1P82094 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMF1P82094 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMF1P82094 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms