Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL7P80098 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL7P80098 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL7P80098 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL7P80098 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL7P80098 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL7P80098 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL7P80098 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL7P80098 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL7P80098 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL7P80098 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL7P80098 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL7P80098 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL7P80098 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL7P80098 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL7P80098 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL7P80098 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL7P80098 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL7P80098 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL7P80098 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL7P80098 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL7P80098 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL7P80098 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL7P80098 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL7P80098 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL7P80098 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL7P80098 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL7P80098 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL7P80098 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL7P80098 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL7P80098 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL7P80098 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL7P80098 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL7P80098 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL7P80098 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL7P80098 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL7P80098 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL7P80098 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCL7P80098 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCL7P80098 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCL7P80098 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCL7P80098 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL7P80098 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL7P80098 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL7P80098 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL7P80098 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL7P80098 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL7P80098 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL7P80098 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL7P80098 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL7P80098 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL7P80098 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL7P80098 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL7P80098 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL7P80098 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL7P80098 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL7P80098 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL7P80098 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL7P80098 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL7P80098 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL7P80098 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL7P80098 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL7P80098 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL7P80098 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL7P80098 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL7P80098 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL7P80098 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL7P80098 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL7P80098 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL7P80098 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL7P80098 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL7P80098 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL7P80098 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL7P80098 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL7P80098 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL7P80098 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL7P80098 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL7P80098 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL7P80098 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL7P80098 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL7P80098 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL7P80098 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL7P80098 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL7P80098 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL7P80098 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL7P80098 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL7P80098 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL7P80098 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL7P80098 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL7P80098 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL7P80098 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL7P80098 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL7P80098 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL7P80098 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL7P80098 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL7P80098 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL7P80098 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL7P80098 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL7P80098 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL7P80098 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms