Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms