Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms