Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB15P59190 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB15P59190 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB15P59190 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB15P59190 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB15P59190 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB15P59190 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB15P59190 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB15P59190 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB15P59190 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB15P59190 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB15P59190 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB15P59190 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB15P59190 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB15P59190 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB15P59190 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB15P59190 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB15P59190 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB15P59190 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB15P59190 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB15P59190 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB15P59190 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB15P59190 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB15P59190 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB15P59190 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB15P59190 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB15P59190 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB15P59190 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB15P59190 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB15P59190 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB15P59190 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB15P59190 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB15P59190 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB15P59190 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB15P59190 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB15P59190 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB15P59190 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB15P59190 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB15P59190 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB15P59190 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB15P59190 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB15P59190 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB15P59190 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB15P59190 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB15P59190 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB15P59190 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB15P59190 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB15P59190 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB15P59190 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB15P59190 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB15P59190 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB15P59190 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB15P59190 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB15P59190 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB15P59190 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB15P59190 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB15P59190 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB15P59190 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB15P59190 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB15P59190 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB15P59190 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB15P59190 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB15P59190 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB15P59190 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB15P59190 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB15P59190 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB15P59190 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB15P59190 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB15P59190 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB15P59190 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB15P59190 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB15P59190 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB15P59190 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB15P59190 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB15P59190 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB15P59190 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB15P59190 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB15P59190 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB15P59190 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB15P59190 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB15P59190 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB15P59190 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB15P59190 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB15P59190 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB15P59190 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB15P59190 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB15P59190 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB15P59190 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB15P59190 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB15P59190 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB15P59190 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB15P59190 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB15P59190 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB15P59190 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB15P59190 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB15P59190 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB15P59190 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB15P59190 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB15P59190 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB15P59190 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms