Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CABP4P57796 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CABP4P57796 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CABP4P57796 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CABP4P57796 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CABP4P57796 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CABP4P57796 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CABP4P57796 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CABP4P57796 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CABP4P57796 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CABP4P57796 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CABP4P57796 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CABP4P57796 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CABP4P57796 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CABP4P57796 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CABP4P57796 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CABP4P57796 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CABP4P57796 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CABP4P57796 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
CABP4P57796 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CABP4P57796 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CABP4P57796 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CABP4P57796 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CABP4P57796 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CABP4P57796 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CABP4P57796 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CABP4P57796 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CABP4P57796 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CABP4P57796 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CABP4P57796 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CABP4P57796 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CABP4P57796 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CABP4P57796 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CABP4P57796 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CABP4P57796 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CABP4P57796 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CABP4P57796 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CABP4P57796 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CABP4P57796 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CABP4P57796 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CABP4P57796 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CABP4P57796 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CABP4P57796 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CABP4P57796 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CABP4P57796 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CABP4P57796 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CABP4P57796 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CABP4P57796 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CABP4P57796 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CABP4P57796 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CABP4P57796 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CABP4P57796 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CABP4P57796 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CABP4P57796 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CABP4P57796 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CABP4P57796 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CABP4P57796 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CABP4P57796 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CABP4P57796 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CABP4P57796 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CABP4P57796 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CABP4P57796 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CABP4P57796 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CABP4P57796 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CABP4P57796 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CABP4P57796 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CABP4P57796 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CABP4P57796 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CABP4P57796 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CABP4P57796 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CABP4P57796 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CABP4P57796 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CABP4P57796 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CABP4P57796 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CABP4P57796 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CABP4P57796 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CABP4P57796 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CABP4P57796 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CABP4P57796 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CABP4P57796 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CABP4P57796 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CABP4P57796 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CABP4P57796 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CABP4P57796 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CABP4P57796 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CABP4P57796 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CABP4P57796 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CABP4P57796 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CABP4P57796 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CABP4P57796 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CABP4P57796 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CABP4P57796 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CABP4P57796 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CABP4P57796 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CABP4P57796 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CABP4P57796 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CABP4P57796 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CABP4P57796 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CABP4P57796 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CABP4P57796 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms