Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP107P57740 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP107P57740 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP107P57740 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP107P57740 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP107P57740 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP107P57740 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP107P57740 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP107P57740 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP107P57740 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP107P57740 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP107P57740 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP107P57740 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP107P57740 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP107P57740 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP107P57740 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP107P57740 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP107P57740 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP107P57740 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP107P57740 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP107P57740 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP107P57740 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP107P57740 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP107P57740 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP107P57740 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP107P57740 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP107P57740 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP107P57740 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP107P57740 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP107P57740 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP107P57740 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP107P57740 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP107P57740 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP107P57740 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP107P57740 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP107P57740 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP107P57740 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP107P57740 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP107P57740 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP107P57740 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP107P57740 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP107P57740 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP107P57740 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP107P57740 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP107P57740 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP107P57740 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP107P57740 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP107P57740 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP107P57740 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP107P57740 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP107P57740 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP107P57740 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP107P57740 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP107P57740 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP107P57740 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP107P57740 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP107P57740 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP107P57740 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP107P57740 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP107P57740 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP107P57740 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP107P57740 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP107P57740 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP107P57740 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP107P57740 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP107P57740 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP107P57740 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP107P57740 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP107P57740 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP107P57740 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP107P57740 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP107P57740 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP107P57740 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP107P57740 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP107P57740 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP107P57740 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP107P57740 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP107P57740 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP107P57740 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP107P57740 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP107P57740 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP107P57740 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP107P57740 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP107P57740 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP107P57740 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP107P57740 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP107P57740 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP107P57740 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP107P57740 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP107P57740 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP107P57740 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP107P57740 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP107P57740 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP107P57740 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP107P57740 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP107P57740 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP107P57740 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP107P57740 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP107P57740 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP107P57740 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms