Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF3P57682 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF3P57682 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF3P57682 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF3P57682 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF3P57682 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF3P57682 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF3P57682 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF3P57682 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF3P57682 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF3P57682 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF3P57682 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF3P57682 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF3P57682 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF3P57682 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF3P57682 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF3P57682 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF3P57682 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF3P57682 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF3P57682 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF3P57682 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF3P57682 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF3P57682 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF3P57682 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF3P57682 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF3P57682 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF3P57682 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF3P57682 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF3P57682 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF3P57682 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF3P57682 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF3P57682 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF3P57682 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF3P57682 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF3P57682 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF3P57682 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF3P57682 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF3P57682 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF3P57682 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF3P57682 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF3P57682 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF3P57682 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF3P57682 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF3P57682 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF3P57682 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF3P57682 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF3P57682 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF3P57682 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF3P57682 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLF3P57682 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLF3P57682 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLF3P57682 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLF3P57682 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLF3P57682 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF3P57682 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF3P57682 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF3P57682 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF3P57682 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF3P57682 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF3P57682 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF3P57682 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF3P57682 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF3P57682 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF3P57682 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF3P57682 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF3P57682 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF3P57682 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF3P57682 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF3P57682 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF3P57682 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF3P57682 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF3P57682 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF3P57682 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF3P57682 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF3P57682 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF3P57682 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF3P57682 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF3P57682 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF3P57682 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF3P57682 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF3P57682 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF3P57682 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF3P57682 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF3P57682 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF3P57682 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF3P57682 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF3P57682 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF3P57682 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF3P57682 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF3P57682 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF3P57682 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF3P57682 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF3P57682 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF3P57682 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF3P57682 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF3P57682 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF3P57682 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF3P57682 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF3P57682 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF3P57682 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms